Ana içeriğe geç

Newick (filogenetik ağaç)

Newick formatında yazılmış bir filogenetik ağacı (türler arası evrimsel/hiyerarşik ilişki ağacı) görsel bir ağaç diyagramı olarak çizer.

Sözdizimi

```newick
((A:0.1,B:0.2):0.3,(C:0.4,D:0.5):0.6);
```

Parantezler dallanmayı, iki nokta üst üste'den sonraki sayılar dal uzunluğunu (mesafe/süre) temsil eder.

Ne işe yarar

Biyoloji, evrimsel ilişkiler ya da genel olarak hiyerarşik/ağaç yapılı ilişkileri metin tabanlı bir formatla göstermek için.

Kaynak

Newick formatının sözdizimi biyoinformatik kaynaklarında yaygın olarak anlatılır ("Newick tree format"). Tsunagi'nin kullandığı görsel kütüphane phylotree.js.

Tsunagi'ye özgü not

Ağacın kendi rengi (yaprak etiketleri, çizgiler) sabit; koyu temada görünürlüğü sağlamak için tüm diyagram renk tersine çevrilir, kütüphane düzeyinde ayrı bir koyu tema yok.